Среди медицинских центров, применяющих АПК «Метатрон» в России:
- Лечебно-диагностический центр Министерства Обороны РФ
- Санаторий «Форос», Крым
- Клиника естественного оздоровления «Кивач» (Республика Карелия)
- Научный центр психического здоровья РАМН
- Детский санаторный комплекс «Русь» (Подмосковье)
- Профессиональная российская команда по велоспорту «Катюша»
- Спасо-Преображенский Валаамский монастырь
- Башкирский Государственный медицинский университет
- Спа-комплекс LUCIANO, Казань
- Клиника профессора Гофмана, г. Санкт-Петербург